Les obres contemplen la creació d’un pas sota les vies que permetrà l’accés a les andanes i la col·locació d’ascensors per millorar l’accessibilitat. També es remodelarà íntegrament l’interior de l’edifici de l’estació, amb la millora dels espais interiors i el bar i la creació d’una zona de lavabos, que permetrà eliminar la caseta de serveis que hi ha actualment a l’exterior de l’edifici.
Els principals treballs contemplen la rehabilitació i ampliació de la marquesina de l’edifici de viatgers i la millora en matèria d’eficiència energètica canviant la il·luminació de l’estació per llum leds. A més es duran a terme tasques de recreixement de l’alçada de les andanes per arribar als 68cm sobre la quota del carril i l’ampliació a 200 metres per facilitar l’estacionament de trens en doble composició així com la instal·lació d’un paviment podotàctil.
El projecte inclou, a més, la creació de nous tancaments per al perímetre del recinte de l’estació i l’ampliació de la llargada de les andanes fins a la quota de , que també es. A més, es construiran unes noves marquesines de 40 metres de llargada a cadascuna de les andanes de l’estació.
L’estació de Santa Margarida i els Monjos és utilitzada en dies laborables per 700 viatgers.
Les millores de l’estació de rodalies dels Monjos s’emmarquen en el Pla d’estacions de Renfe per a rodalia de Barcelona. En total, Renfe invertirà prop de 100 milions d’euros en actuacions centrades principalment en la millora de l’accessibilitat, així com altres tasques de modernització de 39 estacions de la rodalia de Barcelona.